大发3dLogo

热门词:生物显微镜 水质分析仪 微波消解 荧光定量PCR 电化学工作站 生物安全柜

现在位置首页>行业专用>生命科学仪器>DNA测序仪/基因分析仪> 英国Oxford Nanopore BASE Technology 第三代纳米孔基因测序仪

商品编号:49183
分享

英国Oxford Nanopore BASE Technology 第三代纳米孔基因测序仪

价    格:询价

产    地:英国更新时间:2019/7/15 13:41:34

品    牌:Oxford Nanopore型    号:

状    态:正常点击量:5451

18753191326
联系我时,请说明是在大发3d上看到的,谢谢!

济南堃康医疗器械有限公司

联 系 人:甘明

电     话:18753191326

传     真:0531-68629559

等     级: (第 4年)

性     质:生产型,

联系我时请说在大发3d上看到的,谢谢!




Oxford Nanopore Technologies的Hagan Bayley及他的研究小组正致力于改善纳米孔。根据他们之前的工作,他们以a-溶血素来设计纳米孔,并将环式糊精共价结合在孔的内侧(下图)。当核酸外切酶消化单链DNA后,单个碱基落入孔中,它们瞬间与环式糊精相互作用,并阻碍了穿过孔中的电流。每个碱基ATGC以及甲基胞嘧啶都有自己特有的电流振幅,因此很容易转化成DNA序列。每个碱基也有特有的平均停留时间,它的解离速率常数是电压依赖的,+180 mV的电位能确保碱基从孔的另一侧离开。

 


a-溶血素纳米孔(剖面图)以及共价结合的环式糊精(浅蓝色)瞬间结合落入孔中的碱基(红色)。


以往对甲基胞嘧啶进行测序,都要先进行重亚硫酸盐转化,而纳米孔大发3d能直接读出这第五种碱基。这对表观基因组测序的研究人员来说可谓是个好消息。


纳米孔测序预计能满足大部分测序用户的需求:99.8%的准确性相当高,且错误很容易通过计算来纠正。均聚物延伸也没有问题,因为纳米孔记录每一个碱基,而不管其前后的碱基。读长也会很长。Bayley认为:“它有可能读取数千个碱基,序列质量也不会下降。即使中途有一些小差错,它也可以重新开始。”


但是,Oxford Nanopore的测序仪仍面临两个重要的大发3d问题。一是如何将核酸外切酶更好地附着在孔上,让它每次只掉入一个碱基,这是一个大挑战。另一个是并行化。这个问题可能简单一些。他们可以开发出一个芯片,上面有数万个孔,来确保整个测序过程更快速。


在纳米孔测序大发3d的推动下,实现千元基因组的目标指日可待了。


参考文献:
Clarke, J. et al. Continuous base identification for single-molecule nanopore DNA sequencing. Nat. Nanotechnol. advance online publication 22 February, 2009.





猜你喜欢